杨焕明
中国科学院院士、华大基因理事长
杨焕明,1952年10月出生于浙江乐清,基因组学家,中国科学院院士、发展中国家科学院院士、非洲科学院院士、 印度国家科学院外籍院士、德国国家科学院外籍院士、美国国家科学院外籍院士,中国医学科学院教授,华大基因理事长、深圳市华大教育中心院长、东南大学生命健康高等研究院名誉院长。
1978年杨焕明毕业于杭州大学;1982年获得南京铁道医学院硕士学位;1988年获得丹麦哥本哈根大学博士学位,之后在法国、美国从事博士后研究;1994年回到中国,进入中国医学科学院暨中国协和医科大学工作,回国后致力于参加人类基因组计划;1995年获得国家杰出青年科学基金资助;2002年被《科学美国人》评为年度科研领袖人物;2003年出任中国科学院北京基因组研究所所长;2006年当选为欧洲分子生物学组织成员;2007年当选中国科学院院士;2010年获得人类基因组组织越科学成就奖;2014年当选为美国国家科学院外籍院士;2017年获得全国创新争先奖。
杨焕明一直从事基因组科学的研究。杨焕明和他的团队为“国际人类基因组计划” “国际人类单体型图计划”“国际千人基因组计划”“国际癌症基因组计划”等国际合作的基因组计划,以及第一个亚洲人基因组、人类泛基因组学、古人类基因组、肠道Meta基因组的研究做出了重要贡献。作为联合创始人,创建了华大基因和中国科学院北京基因组研究所。
人物经历
1952年10月,杨焕明出生于浙江温州乐清市。
1975年,考入杭州大学(1998年合并组建成立浙江大学)生命科学院
1978年,本科毕业后进入温州医学院(2013年更名为温州医科大学)工作,担任生物室助教。
1979年,考入南京铁道医学院(2000年与东南大学合并)生物系就读研究生 。
1982年,硕士毕业后留校任教,担任生物系讲师。
1984年,前往丹麦哥本哈根大学医学遗传研究所攻读博士学位,师从Professor. Erik Niebuhr。
1988年,博士毕业后前往法国INSERM-CNRS马赛免疫中心(CIML)人类分子遗传学实验室进行博士后研究。
1990年,前往美国波士顿哈佛医学院进行博士后研究。
1992年,在美国洛杉矶加州大学(UCLA)医学院实验病理学系进行博士后研究。
1994年,回到中国,进入中国医学科学院暨中国协和医科大学(CAMS/PUMC)工作,担任医学遗传学教授、博士生导师(至1997年),回国后由原先从事人类遗传学的“细科学”转为基因组研究的“大科学”,致力于参加“国际人类基因组计划” 。
1995年,获得国家杰出青年科学基金资助 。
1997年,担任丹麦奥尔胡斯大学人类遗传研究所客座教授。
1998年,担任中国科学院遗传与发育生物学研究所人类基因组中心主任研究员、博士生导师(至2003年)。
2000年,担任国家863计划“功能基因组与蛋白质组”重大项目首席科学家。
2002年,杨焕明被《科学美国人》被评为年度科研领袖人物,12月10日在纽约接受颁奖。
2003年,担任中国科学院北京基因组研究所所长(至2008年)、研究员、博士生导师。
2006年,入选欧洲分子生物学组织(EMBO)外籍成员。
2007年,担任深圳华大基因研究院理事长。同年当选中国科学院院士 。
2008年,当选发展中国家科学院院士 。
2009年,当选印度国家科学院外籍院士。
2012年,当选德国国家科学院院士 。
2014年,当选美国国家科学院外籍院士 。
2019年10月30日上午,杨焕明院士来到华西医院,围绕“以疾病(健康)为基础的基因组学大数据进展”进行了交流研讨。
2020年12月2日,多维组学联合中心在遗传发育所启用,杨焕明院士等人为联合中心揭牌。
2021年5月,受聘为南开大学兼职教授 [32]。
2024年6月28日,参加的电视节目《你好赛先生第二季》播出。
主要成就
科研成就
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科研综述
杨焕明领导华大中心经过艰苦的拼搏,在世界上首次利用全基因组“霰弹法”策略对大型植物基因组进行测序,独立完成了超级杂交水稻父本籼稻“9311”基因组(大小约为4.6亿个碱基对)的“工作框架图”。该项目的完成,建立和完善了基因组学、生物信息学和蛋白质组学研究的多个技术平台,其水平与发达国家齐步,使中国成为继美国之后的第二个具有全面测定和分析大型全基因组能力的国家,而且从无到有地开发了重复序列识别及注释系统,并率先公布了数据库,促进了“国际联盟”的工作进程,在国际上产生了巨大而深远的影响。杨焕明及其团队所承担的人类基因组、水稻基因组以及家猪、家鸡、家蚕基因组等重大项目使中国的基因组研究得以跻身于世界前沿。杨焕明还特别关注基因组研究的社会影响和基因知识的普及 。
2002年4月,杨焕明及其研究小组在《科学》杂志发表《水稻基因组工作框架图》,在世界上首次将完整的水稻基因组草图序列向公共数据库公开 。
2003年,在抗击非典行动中,杨焕明带领年轻人团队,同舟共济,团结一心,在SARS冠状病毒的基因组研究及建立诊断方法上又做出了贡献,使中国的基因组研究走向了世界,得到了国内外同行与有关部门的肯定。
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学术论著
截至2017年,杨焕明在国际刊物上发表论文100余篇,多项研究成果发表于《Science》、《Nature》等;主编、主译图书10多部,其中撰写的《解读生命丛书》荣获第一届“北京市优秀科普作品奖”最佳奖及第五届“全国优秀科普作品奖科普图书类一等奖”(2003年),撰写的《“天”生与“人”生:生殖与克隆》获得第二届中国出版政府图书奖(2010年) 。
出版著作
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出版日期
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图书名称
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作者
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出版社
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2016.10
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《基因组学 2016》
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杨焕明著
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北京:科学出版社
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2015.12
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《生物科学研究方法丛书 基因组学方法》
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杨焕明
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北京:科学出版社
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2015.03
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《基因的分子生物学 第7版》
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(美)J.D.沃森,T.A.贝克,等编著;杨焕明主译
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北京:科学出版社
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2012.09
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《基因组学方法》
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杨焕明编著
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北京:科学出版社
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2012
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《生命的语言》
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柯林斯,杨焕明
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长沙:湖南科学技术出版社
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2008.05
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《破解遗传密码》
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杨焕明主编
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南京:江苏人民出版社
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2006.07
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《“天”生与“人”生 生殖与克隆》
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杨焕明
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北京:科学出版社
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2005.11
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《解读生命丛书 破解遗传密码》
|
杨焕明
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北京:北京教育出版社
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2005.09
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《基因的分子生物学》
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(美)J. D. 沃森等编著;杨焕明等译
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北京:科学出版社
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2004.01
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《生命的线索》
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(英)约翰·苏尔斯顿,(美)乔治娜·费里著;杨焕明,刘斌译
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北京:中信出版社
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2003.08
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《科学》
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杨焕明著
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上海:上海文化出版社
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2003.05
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《图说非典型肺炎防治》
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杨焕明主编
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北京:科学出版社
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2003
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《Science》
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Huanming Yang, and Pierre Léna. La
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Presses littéraires et artistiques de Shanghai
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2003
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《A holistic approach for rice research and genetic engineering (Volume I)》
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Huanming Yang, Jun Yu, Srinivasan Ramachandran, Shen Quan Pan
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World scientific publication Co. Pt. Ltd
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2002.09
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《破解遗传密码》
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杨焕明主编
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北京:少年儿童出版社
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2000.05
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《人类DNA遗传标记》
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李生斌著,杨焕明审
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人民卫生出版社
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2000.04
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《生命大解密 人类基因组计划》
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杨焕明等著
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北京:中国青年出版社
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1998.07
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《分子生物学前沿技术(第1版)》
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方福德,杨焕明,等著
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北京医科大学/中国协和医科大学联合出版社
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代表论文
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时间
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论文名称
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作者
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期刊信息
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|---|---|---|---|
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2009
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The sequence and de novo assembly of the giant panda genome
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R.Li, W.Fan, …H.Yang, J.Wang and J.Wang
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Nature463(7279):311-7
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2009
|
The Schistosoma japonicum genome reveals features of host- parasite interplay
|
Y.Zhou, ...H.Yang, et al.
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Nature460(7253):345-51
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2009
|
Building the sequence map of the human pan-genome
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R.Li, Y.Li, H.Zheng, R.Luo, ..., H.Yang, J.Wang and J.Wang
|
Nat Biotechnol28(1):57-63
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2009
|
Denovo assembly of human genomes with massively parallel short read sequencing
|
R.Li, H.Zhu, …K.Kristiansen, H.Yang, J.Wang and J.Wang
|
Genome Res20(2):265-72
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2009
|
SNP detection for massively parallel whole-genomere sequencing
|
R.Li, Y.Li, X.Fang, H.Yang, J.Wang, K.Kristiansen and J.Wang
|
Genome Res19(6):1124-32
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2009
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The YH database: the first Asian diploid genome database
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G.Li, L.Ma, ...H.Yang, J.Wang and J.Wang
|
Nucleic Acids Res37:D1025-8
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2009
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The genome of the cucumber, Cucumis sativusL
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S.Huang, …Yang H, et al.
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Nature Genetics
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2009
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Complete Resequencing of 40 Genomes Reveals Domestication Events and Genes in Silkworm (Bombyx)
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Q.Xia,… Yang H, et al.,
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Science326,433
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2008
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The diploid genome sequence of an Asian individual
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Wang,... Yang H, Wang J
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Nature456:60-65
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2007
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A second generation human haplotype map of over 3.1 million SNPs
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The International HapMap Consortium(Yang as the coordinator-in-China)
|
Nature449:851-861
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2007
|
Genome-wide detection and characterization of positive selection in human populations
|
The International HapMap Consortium(Yang as the coordinator-in-China)
|
Nature449:913-918
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2006
|
The DNA Sequence, Annotation and Analysis of Human Chromosome 3
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The Human Chromosome 3 Sequencing Consortium (Yang as the coordinator-in-China)
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Nature 440:1194-1198
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2005
|
A haplotype map of the human genome
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The International Hap Map Consortium(Yang as the coordinator-in-China)
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Nature437:1299-1320
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2005
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The genomes of Oryza sativa: A history of duplications
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Jun Yu,......Huanming Yang
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PLoS Biology3:266-281,
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2004
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A genetic variation map for chicken with 2.8 million single nucleotide polymorphisms
|
International Chicken Polymorphism Map Consortium (Yang as one of the corresponding authors).
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Nature432:717-722
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2004
|
A draft sequence for the genome of the domesticated silkworm (Bombyxmori)
|
Jun Yu,......Huanming Yang
|
Science306:1937-1940
|
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2004
|
Finishing the euchromatic sequence of the human genome
|
International Human Genome Consortium (Yang as the Coordinator-in-China)
|
Nature431:931-945
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2004
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Integrating Ethics and Science in the International HapMap project
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International HapMap Consortium (Yang as the coordinator-in-China)
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Nature Reviews Genetics5:467-475
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2003
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The international HapMap project
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International HapMap Consortium ( Yang as the coordinator-in-China)
|
Nature426:789-796
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2002
|
A draft sequence of the rice (Oryza sativassp. indica)genome
|
Jun Yu, Songnian Hu,….Huanming Yang
|
Science296:79-92
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2002
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A Complete Sequence of theT. tengcongensisGenome
|
Qiyu Bao,……HuanmingYang.
|
Genome Research12:689-700
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2001
|
Initial sequencing and analysis of the human genome
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International Human Genome Sequencing Consortium (Yang as the coordinator-in-China).
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Nature409:860-921
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科研成果奖励
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时间
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项目名称
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奖励名称
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来源
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|---|---|---|---|
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2001年
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1%人类基因组计划项目
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科技部863计划“先进集体称号”
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2002年
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完成水稻基因组和建立中国基因组分析基地
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“香港求是科技基金会”“杰出科技成就集体奖”
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2002年
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国际人类基因组计划1%基因组测序项目
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国家自然科学奖二等奖(集体)
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2003年
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中国科学院─重大创新贡献团队(集体)
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2003年
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“SARS”病毒的基因组学研究
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北京市总工会授予“五一劳动奖”(集体)
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2004年
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中国杂交水稻基因组计划研究项目
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2003年度中国科学院杰出成就科技奖
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2012年
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《“天”生与“人”生:生殖与克隆》
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国家科技进步奖二等奖
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人才培养
杨焕明认为华工基因创新班的实践,不只是为生命科学研究、基因组学研究提供了一种新模式,也是对全球教育和人才的培养探索出了一种新模式,像创新班走出去的学生,只有二十几岁、三十岁不到就能在顶尖学术杂志上发文章。由于传统教育模式过于强调公平,中国很多人才是受到压抑的,潜力没有发挥出来,对于知识和技能,有的学生“吃不完”,但较聪明的学生“吃不饱”。创新机制给学生提供较好的条件和环境,他们就做出了成绩 [17]。
荣誉表彰
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时间
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荣誉/表彰
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来源
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|---|---|---|
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1996年
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国务院政府特殊津贴
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2002年
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美国《科学的美国人》杂志─“2002年世界科学领袖”
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2003年
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日本经济新闻社─“亚洲科技奖”
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2003年
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中国科学技术协会─“全国防治非典型肺炎优秀科技工作者”
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2004年
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中国科学院政府特殊津贴
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2005年
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日本“蚕丝协会特别奖”
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2005年
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第三世界科学院─TWAS生物奖
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2006年
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何梁何利基金“科学与技术进步奖-生命科学奖”
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2008年
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深圳市人民政府“深圳市科技创新奖”
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2008年
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香港中文大学荣誉教授
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2009年
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丹麦奥胡斯大学荣誉博士
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2009年
|
香港中文大学荣誉博士
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2010年
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人类基因组组织(HUGO)卓越科学成就奖
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2010年
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“深圳经济特区30年杰出创新人物”称号
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2012年9月
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德国国家科学院外籍院士
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2014年6月18日
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汤森路透社“2014最具影响力研究人员”
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2017年05月
|
全国创新争先奖
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社会任职
播报
编辑
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时间
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担任职务
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|---|---|
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2023年9月
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温州市红树林研究中心学术委员会主任
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2023年-
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东南大学医药健康行业校友会名誉理事长
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2023年-
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温州市红树林研究中心学术委员会主任
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2013年-
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中国遗传学首席科学传播专家(第一批)
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2008年-
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中国遗传学学会国际合作委员会主席
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2008年-
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中华医学会《国际遗传学杂志》第八届编辑委员会 编委
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2007年-
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国际学术杂志《Biochimie》编委
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2007年-
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国际学术杂志《Plant Science》编委
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2006年-
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《中国医药生物技术》 编委
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2006年-
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国际学术杂志《Genomics》编委
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2006年-
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UNESCO政府生命伦理委员会(IGBC)中国代表
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2005年-
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中国生物工程学会(CSBT)常务理事
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2005年-
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欧洲全球生命科学促进会(EAGLES)副主席
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2003年-
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欧盟生命科学与中国合作协调委员会(EFBIC)委员
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2002年
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中国香港大学医学院名誉教授
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2002年-2007年
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国家自然科学基金委生命科学部第三届专家咨询委员会委员
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2002年-2005年
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国际“人类单体型图(HapMap)计划”协作组中国协调人
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2000年
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中国东南大学兼职教授
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2000年-2004年
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基因组学委员会主席
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1999年-
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“中国遗传资源管理办公室”专家委员会成员
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1999年-2003年
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国际“人类基因计划”协作组中国协调人
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1996年-2000年
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青年遗传学家委员会主席
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IGBC(联合国教科文组织国际政府间伦理委员会)中国代表
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|
中国遗传学会副理事长
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